科学家研发微量小RNA深度测序技术

作者:黄辛

来源:中国科学报

时间:2016-06-30

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导读:中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)吴立刚研究组与上海市计划生育研究所施惠娟研究组合作,优化建立了适用于微量样本的小RNA深度测序文库构建方法,并系统解析了小鼠早期胚胎发育过程中小RNA的动态变化及其生物学功能。相关研究成果日前在线发表于《科学进展》。

中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)吴立刚研究组与上海市计划生育研究所施惠娟研究组合作,优化建立了适用于微量样本的小RNA深度测序文库构建方法,并系统解析了小鼠早期胚胎发育过程中小RNA的动态变化及其生物学功能。相关研究成果日前在线发表于《科学进展》。


目前小RNA深度测序的文库构建通常要几百纳克总RNA,研究配子和胚胎等难以大量获取的生物学样品中的小RNA表达谱较为困难。研究人员通过优化基于连接反应的小RNA文库构建方法,使得总RNA用量降为几十分之一,仅需要10纳克总RNA即可实现对小RNA的深度测序,为研究配子、胚胎和各种干细胞中的小RNA提供了重要技术支撑。


研究人员还利用优化的方法系统,不仅揭示了小鼠早期胚胎发育中miRNA的表达和降解规律,还发现了miRNA对靶基因的调控活性随着胚胎发育而被动态调控的现象,对于理解miRNA在早期胚胎发育中的功能和机制具有重要意义。


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